Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 URM1YIL008W 300 nt2.07□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 PDR8YLR266C 2106 nt2.07□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 UTP22YGR090W 3714 nt2.06□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 BRP1YGL007W 378 nt2.06□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 TMA22YJR014W 597 nt2.06□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 HSK3YKL138C-A 210 nt2.06□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 ERP4YOR016C 624 nt2.06□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.06□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 LYS9YNR050C 1341 nt2.06□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 KOG1YHR186C 4674 nt2.06□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 CDC60YPL160W 3273 nt2.05□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 GCN4YEL009C 846 nt2.05□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.05□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 EMP24YGL200C 612 nt2.05□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 MMS22YLR320W 4365 nt2.05□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 INO80YGL150C 4470 nt2.05□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 QCR7YDR529C 384 nt2.04□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.04□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.04□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 YLR053CYLR053C 327 nt2.04□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 CFT2YLR115W 2580 nt2.04□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 YBL012CYBL012C 402 nt2.04□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 MKT1YNL085W 2493 nt2.04□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 YBR224WYBR224W 516 nt2.04□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.04□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 UTP21YLR409C 2820 nt2.04□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 SET2YJL168C 2202 nt2.03□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 YLR149CYLR149C 2193 nt2.03□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 GYP5YPL249C 2685 nt2.03□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt2.03□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 KIP1YBL063W 3336 nt2.02□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 YDL062WYDL062W 426 nt2.02□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 YLR287CYLR287C 1068 nt2.02□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 YML084WYML084W 309 nt2.02□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 YDR341CYDR341C 1824 nt2.02□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 MNL2YLR057W 2550 nt2.01□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 RBK1YCR036W 1002 nt2.01□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 CBS1YDL069C 690 nt2.01□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 RPL37BYDR500C 267 nt2.01□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 YER079WYER079W 633 nt2.01□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.01□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt2.01□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 YHR210CYHR210C 1026 nt2.01□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 LEE1YPL054W 906 nt2.01□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.01□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 DIE2YGR227W 1578 nt2.01□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 PEP3YLR148W 2757 nt2□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 ALK2YBL009W 2031 nt2□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 SDH7YDR511W 402 nt2□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt2□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 UBC7YMR022W 498 nt2□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 YBL083CYBL083C 426 nt2□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 YOL159CYOL159C 516 nt2□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 DOT6YER088C 2013 nt2□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 SYH1YPL105C 2550 nt2□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 CAT2YML042W 2013 nt1.99□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 SMY1YKL079W 1971 nt1.99□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 UBR2YLR024C 5619 nt1.99□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 RTP1YMR185W 2946 nt1.99□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 MYO2YOR326W 4725 nt1.98□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 YOR392WYOR392W 444 nt1.98□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 YPR099CYPR099C 357 nt1.98□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 YBR184WYBR184W 1572 nt1.98□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 SWF1YDR126W 1011 nt1.97□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 YDR269CYDR269C 324 nt1.97□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 DAD4YDR320C-A 219 nt1.97□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 YBL071CYBL071C 309 nt1.97□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 SNF5YBR289W 2718 nt1.97□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 SPO23YBR250W 1572 nt1.97□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 NAM7YMR080C 2916 nt1.97□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 DFG16YOR030W 1860 nt1.97□□□□□ -2.09
SEC39Q12745 SLM1YIL105C 2061 nt1.96□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 YDR157WYDR157W 402 nt1.96□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 ANS1YHR126C 480 nt1.96□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 YHR138CYHR138C 345 nt1.96□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.96□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 RPS24BYIL069C 408 nt1.96□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 TMA7YLR262C-A 195 nt1.96□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 PGA1YNL158W 597 nt1.96□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 MRPL50YNR022C 420 nt1.96□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 PLC1YPL268W 2610 nt1.95□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 SAC3YDR159W 3906 nt1.95□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 YDL152WYDL152W 366 nt1.95□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 RTT102YGR275W 474 nt1.95□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.95□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 CYB5YNL111C 363 nt1.95□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 YBR285WYBR285W 435 nt1.95□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 YOR093CYOR093C 4947 nt1.95□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 TBS1YBR150C 3285 nt1.95□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 SEF1YBL066C 3447 nt1.94□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 PET309YLR067C 2898 nt1.94□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 YCR043CYCR043C 384 nt1.94□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 YPL238CYPL238C 390 nt1.94□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 GRR1YJR090C 3456 nt1.94□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 RPH1YER169W 2391 nt1.93□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.93□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 RPA34YJL148W 702 nt1.93□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.93□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 YOR053WYOR053W 342 nt1.93□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 PAN3YKL025C 2040 nt1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.7 ms