Protein–RNA interactions for Protein: Q12460

NOP56, Nucleolar protein 56, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP56Q12460 NUP100YKL068W 2880 nt2.49□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 AXL1YPR122W 3627 nt2.49□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 YOR296WYOR296W 3870 nt2.48□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 YLR149CYLR149C 2193 nt2.48□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 SPO22YIL073C 2928 nt2.48□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 LYS9YNR050C 1341 nt2.47□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 RBK1YCR036W 1002 nt2.47□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 PHS1YJL097W 654 nt2.47□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 RPL32YBL092W 393 nt2.47□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 snR36snR36 182 nt2.47□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 USO1YDL058W 5373 nt2.47□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 YBR184WYBR184W 1572 nt2.47□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 PEP3YLR148W 2757 nt2.47□□□□□ -2.01
NOP56Q12460 SCH9YHR205W 2475 nt2.46□□□□□ -2.02 RIP-Chip
NOP56Q12460 DFG16YOR030W 1860 nt2.46□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 MNL2YLR057W 2550 nt2.46□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 YLR012CYLR012C 300 nt2.46□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.46□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 SEF1YBL066C 3447 nt2.46□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 RKM1YPL208W 1752 nt2.46□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 YFL032WYFL032W 321 nt2.45□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 ERP6YGL002W 651 nt2.45□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 ALK2YBL009W 2031 nt2.45□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 DBP10YDL031W 2988 nt2.44□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 TMN3YER113C 2121 nt2.44□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 SGO1YOR073W 1773 nt2.44□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 MMS22YLR320W 4365 nt2.43□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 STB4YMR019W 2850 nt2.43□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 YIL059CYIL059C 366 nt2.43□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 RPL39YJL189W 156 nt2.43□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 PAU8YAL068C 363 nt2.43□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 PAU20YOL161C 363 nt2.43□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 MGM1YOR211C 2646 nt2.43□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 VMR1YHL035C 4779 nt2.42□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 RGA1YOR127W 3024 nt2.42□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 YOL098CYOL098C 3114 nt2.42□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 PAC1YOR269W 1485 nt2.42□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 YDR286CYDR286C 345 nt2.42□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 RPA34YJL148W 702 nt2.42□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 TOR1YJR066W 7413 nt2.42□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 RPO41YFL036W 4056 nt2.42□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 BUB1YGR188C 3066 nt2.41□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 GUP1YGL084C 1683 nt2.41□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt2.41□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt2.41□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 YOR333CYOR333C 417 nt2.41□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 RPS12YOR369C 432 nt2.41□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 SET2YJL168C 2202 nt2.41□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 UBR1YGR184C 5853 nt2.4□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 SMC6YLR383W 3345 nt2.4□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 VPH1YOR270C 2523 nt2.4□□□□□ -2.02
NOP56Q12460 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.4□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt2.4□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.4□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 YBL083CYBL083C 426 nt2.4□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 PEX8YGR077C 1770 nt2.4□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 STE5YDR103W 2754 nt2.39□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 SLM1YIL105C 2061 nt2.39□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 snR65snR65 100 nt2.39□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.39□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 MNE1YOR350C 1992 nt2.38□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 VPS13YLL040C 9435 nt2.38□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 MET18YIL128W 3099 nt2.38□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.38□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 RPS17AYML024W 411 nt2.38□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.38□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 HHT1YBR010W 411 nt2.38□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 ARP8YOR141C 2646 nt2.38□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 FMP23YBR047W 528 nt2.38□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 YPL216WYPL216W 3309 nt2.38□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 SVL3YPL032C 2478 nt2.37□□□□□ -2.03 RIP-Chip
NOP56Q12460 VTC3YPL019C 2508 nt2.37□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 RPL35AYDL191W 363 nt2.37□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 CSN9YDR179C 489 nt2.37□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 PRE4YFR050C 801 nt2.37□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 YHL041WYHL041W 450 nt2.37□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 TMA10YLR327C 261 nt2.37□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 SEC16YPL085W 6588 nt2.37□□□□□ -2.03 RIP-Chip
NOP56Q12460 ELG1YOR144C 2376 nt2.37□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 CLN3YAL040C 1743 nt2.37□□□□□ -2.03 RIP-Chip
NOP56Q12460 ZRG8YER033C 3231 nt2.36□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 YDR008CYDR008C 351 nt2.36□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.36□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.36□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.36□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.36□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 HOP2YGL033W 657 nt2.36□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 RPL42BYHR141C 321 nt2.36□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 TAR1YLR154W-C 375 nt2.36□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 COX14YML129C 213 nt2.36□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 RPL42AYNL162W 321 nt2.36□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 SEC26YDR238C 2922 nt2.36□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 RAV1YJR033C 4074 nt2.35□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 GRR1YJR090C 3456 nt2.35□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 OSH6YKR003W 1347 nt2.35□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 GIP3YPL137C 3831 nt2.35□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 VPS34YLR240W 2628 nt2.35□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 YPL150WYPL150W 2706 nt2.34□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 GCN2YDR283C 4980 nt2.34□□□□□ -2.03
NOP56Q12460 EFR3YMR212C 2349 nt2.34□□□□□ -2.03
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