Protein–RNA interactions for Protein: Q12088

TY1B-LR1, Transposon Ty1-LR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-LR1Q12088 YHR212CYHR212C 336 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-LR1Q12088 VPS25YJR102C 609 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-LR1Q12088 YAR060CYAR060C 336 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-LR1Q12088 RPL9BYNL067W 576 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-LR1Q12088 HDA3YPR179C 1968 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-LR1Q12088 UTP10YJL109C 5310 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-LR1Q12088 SGD1YLR336C 2700 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-LR1Q12088 TSA2YDR453C 591 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-LR1Q12088 SEC5YDR166C 2916 nt0.09□□□□□ -2.39
TY1B-LR1Q12088 MVB12YGR206W 306 nt0.09□□□□□ -2.39
TY1B-LR1Q12088 HSK3YKL138C-A 210 nt0.09□□□□□ -2.39
TY1B-LR1Q12088 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.09□□□□□ -2.39
TY1B-LR1Q12088 DUO1YGL061C 744 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 RSM27YGR215W 333 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 GLG1YKR058W 1851 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 YHL012WYHL012W 1482 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 PGA1YNL158W 597 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 TOF2YKR010C 2316 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 NNF2YGR089W 2811 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 YCR090CYCR090C 549 nt0.07□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 TAP42YMR028W 1101 nt0.07□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 YMR324CYMR324C 243 nt0.07□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 TEX1YNL253W 1269 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 BMT5YIL096C 1011 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 SST2YLR452C 2097 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 SLS1YLR139C 1932 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 OSH6YKR003W 1347 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 SWF1YDR126W 1011 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 TMA20YER007C-A 546 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 SDL1YIL167W 633 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 IZH4YOL101C 939 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 YBR012CYBR012C 420 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 YOR282WYOR282W 321 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 TRS20YBR254C 528 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 NDD1YOR372C 1665 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 YPD1YDL235C 504 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 COG7YGL005C 840 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 COX6YHR051W 447 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 LOA1YPR139C 903 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 AFR1YDR085C 1863 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 VIK1YPL253C 1944 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 YDL206WYDL206W 2289 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 CYC7YEL039C 342 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 RCN1YKL159C 636 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 YLR042CYLR042C 486 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 YOL050CYOL050C 321 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 NUT2YPR168W 474 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 MUD2YKL074C 1584 nt0.03□□□□□ -2.4
TY1B-LR1Q12088 YCR043CYCR043C 384 nt0.02□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.02□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 YDR509WYDR509W 348 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 RPC25YKL144C 639 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 YLR225CYLR225C 1224 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 PIG1YLR273C 1947 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 RPL35BYDL136W 363 nt0.01□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 SLI15YBR156C 2097 nt0□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 YML047W-AYML047W-A 366 nt0□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 YPL034WYPL034W 498 nt0□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 MPT5YGL178W 2580 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 POP8YBL018C 402 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 NBP1YLR457C 960 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 CGI121YML036W 546 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 RPL32YBL092W 393 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 SLM6YBR266C 453 nt-0.01□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 MKT1YNL085W 2493 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 GIC2YDR309C 1152 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 GRX8YLR364W 330 nt-0.02□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 YJL049WYJL049W 1353 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 ALG13YGL047W 609 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 YJR071WYJR071W 369 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 YAL069WYAL069W 315 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 ATX1YNL259C 222 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY1B-LR1Q12088 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-LR1Q12088 GPX2YBR244W 489 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-LR1Q12088 NUR1YDL089W 1455 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-LR1Q12088 DBP6YNR038W 1890 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-LR1Q12088 VPS74YDR372C 1038 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-LR1Q12088 AIM41YOR215C 558 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-LR1Q12088 HAL9YOL089C 3093 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-LR1Q12088 PXA2YKL188C 2562 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY1B-LR1Q12088 VPS52YDR484W 1926 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY1B-LR1Q12088 RPL35AYDL191W 363 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY1B-LR1Q12088 IMP3YHR148W 552 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY1B-LR1Q12088 HYM1YKL189W 1200 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY1B-LR1Q12088 YOL150CYOL150C 312 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY1B-LR1Q12088 AIM44YPL158C 2277 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY1B-LR1Q12088 ISD11YER048W-A 285 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY1B-LR1Q12088 YGR219WYGR219W 342 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY1B-LR1Q12088 snR63snR63 255 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY1B-LR1Q12088 SDH2YLL041C 801 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY1B-LR1Q12088 YLR031WYLR031W 561 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY1B-LR1Q12088 YNR021WYNR021W 1215 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY1B-LR1Q12088 YOL024WYOL024W 519 nt-0.07□□□□□ -2.42
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