Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNA1Q09470 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms