RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: Q08873
SCP1, Transgelin, yeast
Predictions only
Length
200 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SCP1
Q08873
tF(GAA)H2
tF(GAA)H2
73 nt
0.02
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
tF(GAA)M
tF(GAA)M
73 nt
0.02
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
tF(GAA)P1
tF(GAA)P1
73 nt
0.02
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
tF(GAA)P2
tF(GAA)P2
73 nt
0.02
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
YGL006W-A
YGL006W-A
111 nt
0.02
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
YJL114W
YJL114W
681 nt
0.02
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
SMD3
YLR147C
306 nt
0.02
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
HUG1
YML058W-A
207 nt
0.02
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
DLT1
YMR126C
1029 nt
0.02
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
YMR173W-A
YMR173W-A
1185 nt
0.02
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
DDR48
YMR173W
1293 nt
0.02
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
YPR170C
YPR170C
336 nt
0.02
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
IQG1
YPL242C
4488 nt
0.02
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
YGR045C
YGR045C
363 nt
0.01
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
SPO13
YHR014W
876 nt
0.01
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
NEJ1
YLR265C
1029 nt
0.01
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
VAB2
YEL005C
849 nt
0
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
MPT5
YGL178W
2580 nt
0
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
RSM27
YGR215W
333 nt
0
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
CGI121
YML036W
546 nt
0
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
YOL013W-A
YOL013W-A
192 nt
0
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
YOR199W
YOR199W
330 nt
0
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
BIR1
YJR089W
2865 nt
-0.01
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
PAU2
YEL049W
363 nt
-0.01
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
COX6
YHR051W
447 nt
-0.01
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
NUT2
YPR168W
474 nt
-0.01
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
YBR224W
YBR224W
516 nt
-0.01
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
YCR016W
YCR016W
873 nt
-0.02
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
YLR031W
YLR031W
561 nt
-0.02
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
COX12
YLR038C
252 nt
-0.02
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
YHL002C-A
YHL002C-A
489 nt
-0.03
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
YKL183C-A
YKL183C-A
213 nt
-0.03
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
YMR324C
YMR324C
243 nt
-0.03
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
SFG1
YOR315W
1041 nt
-0.03
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
GPX2
YBR244W
489 nt
-0.03
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
AIM44
YPL158C
2277 nt
-0.03
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
DBP6
YNR038W
1890 nt
-0.03
□□□□□ -2.41
SCP1
Q08873
VIK1
YPL253C
1944 nt
-0.04
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
GIC2
YDR309C
1152 nt
-0.04
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
YEL030C-A
YEL030C-A
315 nt
-0.04
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
SBH1
YER087C-B
249 nt
-0.04
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
IMP3
YHR148W
552 nt
-0.04
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
YKL065W-A
YKL065W-A
222 nt
-0.04
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
snR13
snR13
124 nt
-0.04
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
NUT1
YGL151W
3399 nt
-0.05
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
VPS74
YDR372C
1038 nt
-0.05
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
YDR509W
YDR509W
348 nt
-0.05
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
DUO1
YGL061C
744 nt
-0.05
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
YGR265W
YGR265W
411 nt
-0.05
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
YLR042C
YLR042C
486 nt
-0.05
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
YKE2
YLR200W
345 nt
-0.05
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
YBL100W-B
YBL100W-B
5313 nt
-0.05
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
YOR192C-B
YOR192C-B
5313 nt
-0.05
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
SEC8
YPR055W
3198 nt
-0.05
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
SLI15
YBR156C
2097 nt
-0.06
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
MLP2
YIL149C
5040 nt
-0.06
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
YIL134C-A
YIL134C-A
204 nt
-0.06
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
YOL014W
YOL014W
375 nt
-0.06
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
YOR105W
YOR105W
327 nt
-0.06
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
PKH2
YOL100W
3246 nt
-0.07
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
YDR262W
YDR262W
819 nt
-0.07
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
SLX9
YGR081C
633 nt
-0.07
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
PAI3
YMR174C
207 nt
-0.07
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
YOR053W
YOR053W
342 nt
-0.07
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
YOR108C-A
YOR108C-A
210 nt
-0.07
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
YBP2
YGL060W
1926 nt
-0.07
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
SAG1
YJR004C
1953 nt
-0.08
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
NGG1
YDR176W
2109 nt
-0.08
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
YDR003W-A
YDR003W-A
123 nt
-0.08
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
OCA6
YDR067C
675 nt
-0.08
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
NBP1
YLR457C
960 nt
-0.08
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
ATX1
YNL259C
222 nt
-0.08
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
ARP9
YMR033W
1404 nt
-0.08
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
STO1
YMR125W
2586 nt
-0.08
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
VPS52
YDR484W
1926 nt
-0.09
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
SUT2
YPR009W
807 nt
-0.09
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
YPR153W
YPR153W
423 nt
-0.09
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
NUR1
YDL089W
1455 nt
-0.1
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
NOC3
YLR002C
1992 nt
-0.1
□□□□□ -2.42
SCP1
Q08873
MKT1
YNL085W
2493 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
SCP1
Q08873
ALY2
YJL084C
3141 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
SCP1
Q08873
snR63
snR63
255 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
SCP1
Q08873
YEL018C-A
YEL018C-A
534 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
SCP1
Q08873
YER046W-A
YER046W-A
330 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
SCP1
Q08873
YER078W-A
YER078W-A
165 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
SCP1
Q08873
YGR204C-A
YGR204C-A
114 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
SCP1
Q08873
UBC7
YMR022W
498 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
SCP1
Q08873
YBL073W
YBL073W
312 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
SCP1
Q08873
YOL085W-A
YOL085W-A
213 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
SCP1
Q08873
STE5
YDR103W
2754 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
SCP1
Q08873
SWI5
YDR146C
2130 nt
-0.1
□□□□□ -2.43
SCP1
Q08873
YOR192C-A
YOR192C-A
1317 nt
-0.11
□□□□□ -2.43
SCP1
Q08873
PRP5
YBR237W
2550 nt
-0.11
□□□□□ -2.43
SCP1
Q08873
UBC9
YDL064W
474 nt
-0.11
□□□□□ -2.43
SCP1
Q08873
SDH2
YLL041C
801 nt
-0.11
□□□□□ -2.43
SCP1
Q08873
LCL2
YLR104W
396 nt
-0.11
□□□□□ -2.43
SCP1
Q08873
RTC6
YPL183W-A
282 nt
-0.11
□□□□□ -2.43
SCP1
Q08873
PEP3
YLR148W
2757 nt
-0.11
□□□□□ -2.43
SCP1
Q08873
IST3
YIR005W
447 nt
-0.12
□□□□□ -2.43
SCP1
Q08873
LOA1
YPR139C
903 nt
-0.12
□□□□□ -2.43
First
Previous
63
Next
Last
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.9 ms