Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms