Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF8Q02556 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms