Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF3P57682 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF3P57682 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF3P57682 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF3P57682 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF3P57682 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF3P57682 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF3P57682 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLF3P57682 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLF3P57682 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLF3P57682 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLF3P57682 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF3P57682 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF3P57682 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF3P57682 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF3P57682 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF3P57682 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF3P57682 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF3P57682 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF3P57682 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF3P57682 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF3P57682 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF3P57682 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF3P57682 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF3P57682 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF3P57682 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF3P57682 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF3P57682 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF3P57682 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF3P57682 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF3P57682 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF3P57682 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF3P57682 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF3P57682 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF3P57682 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF3P57682 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF3P57682 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF3P57682 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF3P57682 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF3P57682 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF3P57682 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF3P57682 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF3P57682 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF3P57682 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF3P57682 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF3P57682 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF3P57682 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF3P57682 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF3P57682 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF3P57682 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF3P57682 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF3P57682 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF3P57682 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF3P57682 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF3P57682 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF3P57682 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF3P57682 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF3P57682 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF3P57682 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF3P57682 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF3P57682 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF3P57682 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF3P57682 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF3P57682 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF3P57682 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF3P57682 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF3P57682 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF3P57682 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF3P57682 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF3P57682 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF3P57682 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF3P57682 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF3P57682 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF3P57682 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF3P57682 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF3P57682 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF3P57682 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF3P57682 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF3P57682 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF3P57682 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF3P57682 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF3P57682 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF3P57682 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF3P57682 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF3P57682 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF3P57682 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF3P57682 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF3P57682 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF3P57682 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF3P57682 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF3P57682 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF3P57682 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms