Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIPK4P57078 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms