Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GFRA1P56159 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms