Protein–RNA interactions for Protein: P52918

MSN5, Protein MSN5, yeastyeast

Predictions only

Length 1,224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSN5P52918 ALK2YBL009W 2031 nt3.56□□□□□ -1.84
MSN5P52918 CHO2YGR157W 2610 nt3.56□□□□□ -1.84
MSN5P52918 snR43snR43 209 nt3.55□□□□□ -1.84
MSN5P52918 NOP53YPL146C 1368 nt3.54□□□□□ -1.84
MSN5P52918 YMR31YFR049W 372 nt3.54□□□□□ -1.84
MSN5P52918 PAN3YKL025C 2040 nt3.54□□□□□ -1.84
MSN5P52918 PLC1YPL268W 2610 nt3.53□□□□□ -1.84
MSN5P52918 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt3.53□□□□□ -1.84
MSN5P52918 RPL25YOL127W 429 nt3.53□□□□□ -1.84
MSN5P52918 YOR333CYOR333C 417 nt3.53□□□□□ -1.84
MSN5P52918 DUF1YOL087C 3351 nt3.53□□□□□ -1.84
MSN5P52918 RAD5YLR032W 3510 nt3.52□□□□□ -1.85
MSN5P52918 CHS3YBR023C 3498 nt3.52□□□□□ -1.85
MSN5P52918 USE1YGL098W 738 nt3.52□□□□□ -1.85
MSN5P52918 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt3.52□□□□□ -1.85
MSN5P52918 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt3.52□□□□□ -1.85
MSN5P52918 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt3.52□□□□□ -1.85
MSN5P52918 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt3.52□□□□□ -1.85
MSN5P52918 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt3.52□□□□□ -1.85
MSN5P52918 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt3.52□□□□□ -1.85
MSN5P52918 RTC6YPL183W-A 282 nt3.52□□□□□ -1.85
MSN5P52918 ECM12YHR021W-A 456 nt3.51□□□□□ -1.85
MSN5P52918 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt3.51□□□□□ -1.85
MSN5P52918 RPL33BYOR234C 324 nt3.51□□□□□ -1.85
MSN5P52918 EXO84YBR102C 2262 nt3.51□□□□□ -1.85
MSN5P52918 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.51□□□□□ -1.85
MSN5P52918 VBA4YDR119W 2307 nt3.5□□□□□ -1.85
MSN5P52918 ASG1YIL130W 2895 nt3.5□□□□□ -1.85
MSN5P52918 PSO2YMR137C 1986 nt3.5□□□□□ -1.85
MSN5P52918 SLN1YIL147C 3663 nt3.49□□□□□ -1.85
MSN5P52918 YEL043WYEL043W 2871 nt3.49□□□□□ -1.85
MSN5P52918 PMP2YEL017C-A 132 nt3.49□□□□□ -1.85
MSN5P52918 RPS17AYML024W 411 nt3.49□□□□□ -1.85
MSN5P52918 YJL070CYJL070C 2667 nt3.49□□□□□ -1.85
MSN5P52918 SET1YHR119W 3243 nt3.49□□□□□ -1.85
MSN5P52918 SPO21YOL091W 1830 nt3.49□□□□□ -1.85
MSN5P52918 SSQ1YLR369W 1974 nt3.49□□□□□ -1.85
MSN5P52918 STT4YLR305C 5703 nt3.48□□□□□ -1.85
MSN5P52918 STE11YLR362W 2154 nt3.48□□□□□ -1.85
MSN5P52918 BAS1YKR099W 2436 nt3.48□□□□□ -1.85
MSN5P52918 RPS21AYKR057W 264 nt3.48□□□□□ -1.85
MSN5P52918 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt3.48□□□□□ -1.85
MSN5P52918 RLI1YDR091C 1827 nt3.48□□□□□ -1.85
MSN5P52918 ROM1YGR070W 3468 nt3.48□□□□□ -1.85
MSN5P52918 SPO14YKR031C 5052 nt3.48□□□□□ -1.85
MSN5P52918 GCN1YGL195W 8019 nt3.47□□□□□ -1.85
MSN5P52918 YEL025CYEL025C 3567 nt3.47□□□□□ -1.85
MSN5P52918 HEH2YDR458C 1992 nt3.47□□□□□ -1.85
MSN5P52918 UBP1YDL122W 2430 nt3.47□□□□□ -1.85
MSN5P52918 YOR345CYOR345C 351 nt3.47□□□□□ -1.85
MSN5P52918 MIT1YEL007W 2001 nt3.47□□□□□ -1.85
MSN5P52918 FAR1YJL157C 2493 nt3.47□□□□□ -1.85
MSN5P52918 EFR3YMR212C 2349 nt3.47□□□□□ -1.85
MSN5P52918 PHO81YGR233C 3537 nt3.47□□□□□ -1.85
MSN5P52918 SGD1YLR336C 2700 nt3.46□□□□□ -1.86
MSN5P52918 COS111YBR203W 2775 nt3.46□□□□□ -1.86
MSN5P52918 TFC8YPL007C 1767 nt3.46□□□□□ -1.86
MSN5P52918 YDR186CYDR186C 2634 nt3.45□□□□□ -1.86
MSN5P52918 REG1YDR028C 3045 nt3.45□□□□□ -1.86
MSN5P52918 TAO3YIL129C 7131 nt3.45□□□□□ -1.86
MSN5P52918 PIG1YLR273C 1947 nt3.45□□□□□ -1.86
MSN5P52918 RPN1YHR027C 2982 nt3.45□□□□□ -1.86
MSN5P52918 YIR044CYIR044C 186 nt3.45□□□□□ -1.86
MSN5P52918 YBL065WYBL065W 345 nt3.45□□□□□ -1.86
MSN5P52918 RIX1YHR197W 2292 nt3.45□□□□□ -1.86
MSN5P52918 REV3YPL167C 4515 nt3.45□□□□□ -1.86
MSN5P52918 PSK2YOL045W 3306 nt3.44□□□□□ -1.86
MSN5P52918 MYO5YMR109W 3660 nt3.44□□□□□ -1.86
MSN5P52918 TIM11YDR322C-A 291 nt3.44□□□□□ -1.86
MSN5P52918 BRP1YGL007W 378 nt3.44□□□□□ -1.86
MSN5P52918 PDR3YBL005W 2931 nt3.43□□□□□ -1.86
MSN5P52918 FLO1YAR050W 4614 nt3.43□□□□□ -1.86
MSN5P52918 ITC1YGL133W 3795 nt3.43□□□□□ -1.86
MSN5P52918 YOR218CYOR218C 420 nt3.43□□□□□ -1.86
MSN5P52918 SPO71YDR104C 3738 nt3.43□□□□□ -1.86
MSN5P52918 SOK1YDR006C 2706 nt3.43□□□□□ -1.86
MSN5P52918 MDM1YML104C 3384 nt3.43□□□□□ -1.86
MSN5P52918 MPT5YGL178W 2580 nt3.43□□□□□ -1.86
MSN5P52918 MAK21YDR060W 3078 nt3.42□□□□□ -1.86
MSN5P52918 CLN3YAL040C 1743 nt3.42□□□□□ -1.86
MSN5P52918 YJL022WYJL022W 309 nt3.42□□□□□ -1.86
MSN5P52918 RCY1YJL204C 2523 nt3.42□□□□□ -1.86
MSN5P52918 DBP7YKR024C 2229 nt3.42□□□□□ -1.86
MSN5P52918 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.41□□□□□ -1.86
MSN5P52918 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.41□□□□□ -1.86
MSN5P52918 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.41□□□□□ -1.86
MSN5P52918 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.41□□□□□ -1.86
MSN5P52918 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.41□□□□□ -1.86
MSN5P52918 YCL019WYCL019W 5313 nt3.41□□□□□ -1.86
MSN5P52918 INP2YMR163C 2118 nt3.41□□□□□ -1.86
MSN5P52918 VPH1YOR270C 2523 nt3.41□□□□□ -1.86
MSN5P52918 GIS4YML006C 2325 nt3.41□□□□□ -1.86
MSN5P52918 RPL6AYML073C 531 nt3.41□□□□□ -1.86
MSN5P52918 LSM7YNL147W 348 nt3.41□□□□□ -1.86
MSN5P52918 ACM1YPL267W 630 nt3.41□□□□□ -1.86
MSN5P52918 VMA9YCL005W-A 222 nt3.41□□□□□ -1.86
MSN5P52918 PUF4YGL014W 2667 nt3.41□□□□□ -1.86
MSN5P52918 ILS1YBL076C 3219 nt3.41□□□□□ -1.86
MSN5P52918 NEW1YPL226W 3591 nt3.41□□□□□ -1.86
MSN5P52918 BOI1YBL085W 2943 nt3.4□□□□□ -1.86
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