Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB27AP51159 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB27AP51159 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms