Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSEN2P49810 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN2P49810 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms