Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA4P43694 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA4P43694 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA4P43694 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA4P43694 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA4P43694 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA4P43694 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA4P43694 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA4P43694 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA4P43694 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA4P43694 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA4P43694 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA4P43694 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA4P43694 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA4P43694 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA4P43694 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA4P43694 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA4P43694 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA4P43694 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA4P43694 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA4P43694 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA4P43694 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA4P43694 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA4P43694 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA4P43694 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA4P43694 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA4P43694 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA4P43694 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA4P43694 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA4P43694 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA4P43694 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA4P43694 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA4P43694 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA4P43694 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA4P43694 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA4P43694 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA4P43694 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA4P43694 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA4P43694 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA4P43694 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA4P43694 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATA4P43694 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATA4P43694 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATA4P43694 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATA4P43694 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATA4P43694 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATA4P43694 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA4P43694 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GATA4P43694 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATA4P43694 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GATA4P43694 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATA4P43694 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GATA4P43694 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATA4P43694 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATA4P43694 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GATA4P43694 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATA4P43694 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATA4P43694 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GATA4P43694 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATA4P43694 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATA4P43694 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATA4P43694 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GATA4P43694 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GATA4P43694 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATA4P43694 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GATA4P43694 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GATA4P43694 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATA4P43694 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA4P43694 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA4P43694 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA4P43694 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA4P43694 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA4P43694 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA4P43694 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA4P43694 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms