Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL4P36578 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL4P36578 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL4P36578 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL4P36578 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL4P36578 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL4P36578 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL4P36578 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL4P36578 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL4P36578 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL4P36578 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL4P36578 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL4P36578 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL4P36578 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL4P36578 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL4P36578 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL4P36578 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL4P36578 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL4P36578 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL4P36578 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL4P36578 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL4P36578 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL4P36578 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL4P36578 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL4P36578 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL4P36578 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL4P36578 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL4P36578 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL4P36578 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL4P36578 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL4P36578 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL4P36578 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL4P36578 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL4P36578 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL4P36578 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL4P36578 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL4P36578 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL4P36578 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL4P36578 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL4P36578 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL4P36578 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL4P36578 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL4P36578 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL4P36578 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL4P36578 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL4P36578 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL4P36578 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL4P36578 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL4P36578 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL4P36578 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms