Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms