Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD247P20963 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD247P20963 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD247P20963 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD247P20963 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD247P20963 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD247P20963 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD247P20963 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD247P20963 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD247P20963 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD247P20963 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD247P20963 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD247P20963 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD247P20963 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD247P20963 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD247P20963 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD247P20963 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD247P20963 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD247P20963 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD247P20963 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD247P20963 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD247P20963 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD247P20963 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD247P20963 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD247P20963 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD247P20963 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD247P20963 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD247P20963 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD247P20963 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD247P20963 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD247P20963 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CD247P20963 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD247P20963 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD247P20963 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CD247P20963 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD247P20963 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD247P20963 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD247P20963 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms