Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGB6P18564 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB6P18564 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms