Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EGR1P18146 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EGR1P18146 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EGR1P18146 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EGR1P18146 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
EGR1P18146 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EGR1P18146 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR1P18146 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR1P18146 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR1P18146 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR1P18146 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR1P18146 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR1P18146 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR1P18146 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR1P18146 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR1P18146 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR1P18146 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR1P18146 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR1P18146 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR1P18146 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR1P18146 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR1P18146 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR1P18146 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR1P18146 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR1P18146 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR1P18146 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR1P18146 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR1P18146 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR1P18146 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR1P18146 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR1P18146 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EGR1P18146 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR1P18146 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR1P18146 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR1P18146 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR1P18146 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR1P18146 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms