Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI3P10071 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI3P10071 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI3P10071 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GLI3P10071 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GLI3P10071 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GLI3P10071 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GLI3P10071 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GLI3P10071 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI3P10071 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI3P10071 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI3P10071 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI3P10071 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI3P10071 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI3P10071 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI3P10071 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI3P10071 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI3P10071 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI3P10071 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI3P10071 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI3P10071 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI3P10071 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI3P10071 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI3P10071 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI3P10071 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI3P10071 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI3P10071 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI3P10071 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI3P10071 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI3P10071 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI3P10071 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI3P10071 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI3P10071 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI3P10071 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI3P10071 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI3P10071 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI3P10071 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI3P10071 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GLI3P10071 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
GLI3P10071 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
GLI3P10071 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
GLI3P10071 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GLI3P10071 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GLI3P10071 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
GLI3P10071 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.92
GLI3P10071 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GLI3P10071 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GLI3P10071 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GLI3P10071 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GLI3P10071 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GLI3P10071 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GLI3P10071 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GLI3P10071 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GLI3P10071 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GLI3P10071 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GLI3P10071 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GLI3P10071 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GLI3P10071 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GLI3P10071 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GLI3P10071 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GLI3P10071 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GLI3P10071 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GLI3P10071 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GLI3P10071 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GLI3P10071 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GLI3P10071 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GLI3P10071 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GLI3P10071 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GLI3P10071 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GLI3P10071 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
GLI3P10071 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
GLI3P10071 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GLI3P10071 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
GLI3P10071 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GLI3P10071 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GLI3P10071 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GLI3P10071 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GLI3P10071 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GLI3P10071 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GLI3P10071 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GLI3P10071 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GLI3P10071 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GLI3P10071 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GLI3P10071 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GLI3P10071 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GLI3P10071 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GLI3P10071 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GLI3P10071 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GLI3P10071 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GLI3P10071 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GLI3P10071 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GLI3P10071 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GLI3P10071 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GLI3P10071 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GLI3P10071 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GLI3P10071 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GLI3P10071 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GLI3P10071 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GLI3P10071 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GLI3P10071 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms