Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP2CP0DJJ0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms