Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP1P09874 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP1P09874 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP1P09874 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP1P09874 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP1P09874 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP1P09874 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP1P09874 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP1P09874 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP1P09874 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP1P09874 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP1P09874 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP1P09874 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP1P09874 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP1P09874 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP1P09874 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP1P09874 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP1P09874 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP1P09874 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP1P09874 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP1P09874 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP1P09874 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP1P09874 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP1P09874 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP1P09874 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP1P09874 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP1P09874 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP1P09874 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP1P09874 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP1P09874 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP1P09874 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP1P09874 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP1P09874 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP1P09874 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP1P09874 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP1P09874 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP1P09874 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP1P09874 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP1P09874 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP1P09874 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP1P09874 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP1P09874 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP1P09874 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP1P09874 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP1P09874 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP1P09874 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP1P09874 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP1P09874 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP1P09874 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP1P09874 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP1P09874 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP1P09874 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP1P09874 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP1P09874 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP1P09874 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP1P09874 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP1P09874 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP1P09874 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP1P09874 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP1P09874 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PARP1P09874 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP1P09874 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP1P09874 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP1P09874 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP1P09874 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP1P09874 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP1P09874 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP1P09874 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP1P09874 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP1P09874 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP1P09874 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP1P09874 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP1P09874 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP1P09874 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP1P09874 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms