Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOP08100 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOP08100 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOP08100 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOP08100 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOP08100 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOP08100 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOP08100 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOP08100 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHOP08100 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOP08100 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOP08100 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOP08100 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOP08100 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOP08100 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOP08100 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOP08100 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOP08100 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOP08100 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOP08100 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOP08100 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOP08100 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOP08100 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOP08100 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOP08100 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOP08100 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOP08100 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOP08100 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOP08100 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOP08100 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOP08100 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOP08100 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOP08100 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOP08100 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOP08100 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOP08100 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOP08100 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOP08100 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOP08100 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOP08100 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOP08100 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOP08100 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOP08100 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOP08100 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOP08100 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOP08100 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOP08100 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOP08100 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOP08100 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOP08100 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOP08100 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOP08100 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOP08100 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOP08100 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOP08100 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOP08100 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOP08100 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOP08100 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOP08100 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOP08100 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOP08100 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOP08100 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOP08100 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOP08100 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOP08100 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHOP08100 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHOP08100 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHOP08100 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOP08100 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOP08100 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOP08100 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOP08100 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOP08100 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOP08100 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOP08100 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOP08100 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOP08100 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOP08100 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOP08100 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOP08100 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOP08100 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOP08100 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOP08100 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOP08100 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOP08100 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOP08100 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOP08100 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOP08100 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOP08100 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOP08100 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOP08100 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOP08100 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOP08100 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOP08100 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOP08100 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOP08100 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOP08100 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOP08100 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOP08100 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOP08100 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms