Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP9AO75110 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP9AO75110 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms