Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNQ3O43525 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNQ3O43525 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms