Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA2O43364 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXA2O43364 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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