Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
VGFO15240 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VGFO15240 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VGFO15240 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VGFO15240 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VGFO15240 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VGFO15240 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VGFO15240 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VGFO15240 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VGFO15240 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VGFO15240 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VGFO15240 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VGFO15240 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VGFO15240 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VGFO15240 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
VGFO15240 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VGFO15240 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VGFO15240 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
VGFO15240 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
VGFO15240 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VGFO15240 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VGFO15240 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VGFO15240 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VGFO15240 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VGFO15240 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VGFO15240 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VGFO15240 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VGFO15240 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VGFO15240 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VGFO15240 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VGFO15240 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VGFO15240 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VGFO15240 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VGFO15240 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
VGFO15240 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VGFO15240 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VGFO15240 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VGFO15240 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
VGFO15240 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
VGFO15240 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VGFO15240 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VGFO15240 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VGFO15240 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VGFO15240 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VGFO15240 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VGFO15240 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VGFO15240 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VGFO15240 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VGFO15240 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VGFO15240 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VGFO15240 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VGFO15240 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VGFO15240 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VGFO15240 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VGFO15240 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VGFO15240 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
VGFO15240 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VGFO15240 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VGFO15240 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VGFO15240 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
VGFO15240 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VGFO15240 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VGFO15240 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VGFO15240 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VGFO15240 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VGFO15240 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VGFO15240 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VGFO15240 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VGFO15240 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VGFO15240 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VGFO15240 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VGFO15240 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VGFO15240 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VGFO15240 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VGFO15240 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VGFO15240 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VGFO15240 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VGFO15240 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VGFO15240 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VGFO15240 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VGFO15240 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VGFO15240 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VGFO15240 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VGFO15240 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VGFO15240 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VGFO15240 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VGFO15240 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VGFO15240 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VGFO15240 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
VGFO15240 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
VGFO15240 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VGFO15240 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VGFO15240 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VGFO15240 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VGFO15240 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VGFO15240 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VGFO15240 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VGFO15240 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VGFO15240 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VGFO15240 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
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