Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIK3C2AO00443 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIK3C2AO00443 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIK3C2AO00443 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIK3C2AO00443 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PIK3C2AO00443 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIK3C2AO00443 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PIK3C2AO00443 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PIK3C2AO00443 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PIK3C2AO00443 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PIK3C2AO00443 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIK3C2AO00443 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms