Protein–RNA interactions for Protein: J3QL48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QL48 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3QL48 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3QL48 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3QL48 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3QL48 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3QL48 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3QL48 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3QL48 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3QL48 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3QL48 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3QL48 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3QL48 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3QL48 RN7SL819P-201ENST00000581896 270 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
J3QL48 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3QL48 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
J3QL48 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
J3QL48 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3QL48 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3QL48 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3QL48 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3QL48 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3QL48 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3QL48 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
J3QL48 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 AL645634.1-201ENST00000418426 462 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 AC098483.1-201ENST00000438623 955 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
J3QL48 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 IL12A-AS1-201ENST00000462431 988 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 LINC02057-201ENST00000503882 640 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 AP001099.1-201ENST00000579385 855 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 LINC00976-203ENST00000630386 866 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 AL354892.3-201ENST00000586101 1630 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
J3QL48 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms