Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200CA6NKL6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200CA6NKL6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200CA6NKL6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200CA6NKL6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200CA6NKL6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200CA6NKL6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200CA6NKL6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200CA6NKL6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200CA6NKL6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200CA6NKL6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200CA6NKL6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200CA6NKL6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200CA6NKL6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200CA6NKL6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200CA6NKL6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200CA6NKL6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200CA6NKL6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200CA6NKL6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM200CA6NKL6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM200CA6NKL6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms