Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms