Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM3A6NDB9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms