Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L4A6NCW7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L4A6NCW7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms