Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POTEB3A0JP26 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POTEB3A0JP26 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms