Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX12Q9UMY4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms