Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC9Q9UKV0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms