Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP28Q9P2N2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms