Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HCN3Q9P1Z3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HCN3Q9P1Z3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms