Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMOD3Q9NYL9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
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