Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms