Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
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