Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CASS4Q9NQ75 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CASS4Q9NQ75 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms