Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX9Q9NQ69 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms