Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4AQ9BY43 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms