Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF8Q9BRL6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms