Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EYA3Q99504 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms