Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIGSQ96S52 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms