Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CICQ96RK0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CICQ96RK0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms