Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NLRP3Q96P20 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP3Q96P20 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms