Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM47Q96LD4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms